En principe, il revient à l'enseignant(e) d'actualiser les apprentissages dans sa salle de classe d'après les capacités, les intérêts et les besoins de ses élèves. À certains moments, les activités proposées seront spécifiques à une matière enseignée, ex: la manipulation d'objets afin d'ancrer un concept en mathématiques, la soustraction par exemple; cette habileté doit être maîtrisée afin d'être réinvestie dans la résolution de problèmes réels. À d'autres moments, l'enseignement se fera au moyen d'unités d'intégration des apprentissages bâties autour d'un thème représentatif des intérêts des intervenants (enfants et enseignant(e)s) ou d'une habileté de pensée en tenant compte du matériel disponible et des objectifs à atteindre. Le thème sera donc exploité par une série d'activités qui touchera des objectifs des disciplines visées: le français, les sciences humaines, les mathématiques, les sciences, les sciences humaines, les arts plastiques, la musique. Cette pédagogie «interdisciplinaire» découle directement des travaux de chercheurs tels que Freinet, Piaget, Dewey, qui tous ont constaté que l'enfant vit globalement la réalité et donc s'accommode mal à une pédagogie qui fragmente ses apprentissages. La pédagogie interdisciplinaire constitue un modèle d'enseignement économique en temps puisqu'elle permet l'intégration des apprentissages dans les différentes matières et à travers les niveaux, ce qui est un avantage certain pour les classes multi-programmes; elle est aussi efficace puisqu'elle rend les apprentissages plus pertinents pour l'élève en lui proposant des activités basées sur la résolution de problèmes réels lui permettant ainsi de développer des compétences transférables à n'importe quel type de situation. En d'autres mots, l'élève apprend à apprendre.